Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms