Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Hoxc12Q8K5B8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Hoxc12Q8K5B8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Hoxc12Q8K5B8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Hoxc12Q8K5B8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Hoxc12Q8K5B8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Hoxc12Q8K5B8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Hoxc12Q8K5B8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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