Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms