Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ssh3Q8K330 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssh3Q8K330 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms