Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Fcho1Q8K285 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Fcho1Q8K285 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Fcho1Q8K285 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Fcho1Q8K285 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Fcho1Q8K285 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Fcho1Q8K285 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Fcho1Q8K285 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Fcho1Q8K285 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Fcho1Q8K285 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Fcho1Q8K285 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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