Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nek9Q8K1R7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek9Q8K1R7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms