Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LgsnQ8CIX8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LgsnQ8CIX8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms