Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne4Q8CII8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms