Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mterf1aQ8CHZ9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms