Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Upp2Q8CGR7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Upp2Q8CGR7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms