Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms