Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Klf17Q8CFA7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf17Q8CFA7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf17Q8CFA7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf17Q8CFA7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf17Q8CFA7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf17Q8CFA7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf17Q8CFA7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf17Q8CFA7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Klf17Q8CFA7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms