Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms