Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cnot2Q8C5L3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cnot2Q8C5L3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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