Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx16Q8C080 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Snx16Q8C080 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snx16Q8C080 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx16Q8C080 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snx16Q8C080 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snx16Q8C080 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Snx16Q8C080 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Snx16Q8C080 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx16Q8C080 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms