Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snx17Q8BVL3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Snx17Q8BVL3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Snx17Q8BVL3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Snx17Q8BVL3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms