Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gga3Q8BMI3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms