Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan12Q8BKT6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms