Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tubgcp5Q8BKN5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tubgcp5Q8BKN5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tubgcp5Q8BKN5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tubgcp5Q8BKN5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tubgcp5Q8BKN5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tubgcp5Q8BKN5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tubgcp5Q8BKN5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Tubgcp5Q8BKN5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tubgcp5Q8BKN5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tubgcp5Q8BKN5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tubgcp5Q8BKN5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tubgcp5Q8BKN5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tubgcp5Q8BKN5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tubgcp5Q8BKN5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tubgcp5Q8BKN5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tubgcp5Q8BKN5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tubgcp5Q8BKN5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tubgcp5Q8BKN5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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