Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2-M10.2Q85ZW9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms