Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms