Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp8Q80YR6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms