Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Kdm5bQ80Y84 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm5bQ80Y84 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms