Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Ttc28Q80XJ3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Ttc28Q80XJ3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Ttc28Q80XJ3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Ttc28Q80XJ3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
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Ttc28Q80XJ3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ttc28Q80XJ3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc28Q80XJ3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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