Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Zbed4Q80WQ9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Zbed4Q80WQ9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Zbed4Q80WQ9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Zbed4Q80WQ9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Zbed4Q80WQ9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms