Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ell3Q80VR2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms