Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube3cQ80U95 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube3cQ80U95 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms