Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2q1Q7TSS2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms