Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnf1Q7TSH7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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