Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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