Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfsf18Q7TS55 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms