Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms