Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smap2Q7TN29 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smap2Q7TN29 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smap2Q7TN29 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smap2Q7TN29 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smap2Q7TN29 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms