Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Shq1Q7TMX5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Shq1Q7TMX5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms