Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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ScocQ78YZ6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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