Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vma21Q78T54 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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