Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rph3alQ768S4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms