Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx13Q6PHS6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms