Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CtifQ6PEE2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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