Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim37Q6PCX9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim37Q6PCX9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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