Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sohlh1Q6IUP1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms