Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
CltbQ6IRU5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms