Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms