Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ss18Q62280 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ss18Q62280 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ss18Q62280 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ss18Q62280 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ss18Q62280 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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