Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rbm38Q62176 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbm38Q62176 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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