Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nell2Q61220 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nell2Q61220 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nell2Q61220 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nell2Q61220 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms