Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sim1Q61045 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms