Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp1r1bQ60829 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppp1r1bQ60829 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms