Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atf3Q60765 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atf3Q60765 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms