Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prdm1Q60636 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prdm1Q60636 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm1Q60636 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prdm1Q60636 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prdm1Q60636 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prdm1Q60636 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prdm1Q60636 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prdm1Q60636 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prdm1Q60636 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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